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2021年5月7日

中大研發電腦演算平台 創新通過基因數據實時評估疫苗功效

2021年5月7日
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中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院王海天教授(右)及徐仲鍈教授領導的研究團隊,成功研發「電腦模擬生物信息演算法」,能夠在公眾大規模接種疫苗前,率先預測疫苗的功效。

徐仲鍈教授指出,實時預測疫苗功效可為決策者提供有用資訊,協助他們選擇最適合當地民眾的疫苗。

王海天教授認為,適時掌握疫苗產品於群體中可達致的成效,有助疫苗製造商優化疫苗的病毒成分。

疫苗成分與流行病毒之間出現的基因錯配水平差異,令流感疫苗的功效每年發生變化。對此,香港中文大學(中大)醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院王海天教徐仲鍈教授領導的研究團隊,成功研發出一套「電腦模擬生物信息演算法」,以預測疫苗功效。該演算法可在公眾大規模接種疫苗前,率先預測疫苗的功效。在團隊最新的研究結果中,此方法可捕捉到八成疫苗功效的變化,並進行預測。

是次研發成果創新利用基因數據實時評估疫苗功效,有助政府在每年的流感季節及早掌握疫苗功效,適當調度醫療系統資源,做好疫情防控工作。研究結果已在醫學期刊《Vaccine》發布。

及時提供資訊 優化流感季節的醫療資源調配和疫苗接種計劃

傳統上,疫苗功效需在公眾廣泛接種流感疫苗後,才能進行調查評估,令疫苗接種策略和醫療資源分配策略的優化大大受到限制。

中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院研究人員根據其於2018年開發的專利技術,透過研究流感疫苗功效與病毒及疫苗株之間基因錯配的關聯,研發出「電腦模擬生物信息演算法」。研究人員更發現,流感疫苗功效的變化有相當程度可以用基因錯配解釋。此外,這項演算法綜合考慮了病毒基因組中多個基因片段的遺傳信息,整合不同基因的信息有助於更準確的評估疫苗功效。

這套演算法創新利用基因數據,實時監測及評估流感疫苗功效。演算法得出的結果可供決策者參考,為政府提供相關信息,有助在流感季節發現接種的疫苗與實際流行的流感病毒存在基因錯配後,適當調配公立醫院人力物力資源,為防控流感病毒流行作更好的準備和應對。

中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院臨床研究及生物統計中心主任徐仲鍈教授表示:「了解病毒基因錯配和疫苗功效之間的關聯,有助在病毒廣泛傳播前掌握疫苗功效,這對公共衞生有重大意義。對於全年都受着流感病毒威脅的地區,例如熱帶或亞熱帶地區,決策者在選擇推廣接種北半球或南半球疫苗株的產品時,往往會面對很多不確定性。實時預測疫苗功效可提供有用資訊,協助他們選擇最適合當地居民的疫苗。」

中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院副教授王海天教指出:「這套演算法可以就疫苗產品於群體中達到的預期效果,適時提供資訊,並有助疫苗製造商優化疫苗的病毒成分。」

另外,研究團隊建立了一個診所端網絡平台,為醫生提供疫苗的實時評估信息。

研究論文全文:

In silico prediction of influenza vaccine effectiveness by sequence analysis

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0264410X21000062

相關研究:

Differential Influence of Age on the Relationship between Genetic Mismatch and A (H1N1) pdm09 Vaccine Effectiveness 

https://www.mdpi.com/1999-4915/13/4/619



中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院王海天教授(右)及徐仲鍈教授領導的研究團隊,成功研發「電腦模擬生物信息演算法」,能夠在公眾大規模接種疫苗前,率先預測疫苗的功效。

中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院王海天教授(右)及徐仲鍈教授領導的研究團隊,成功研發「電腦模擬生物信息演算法」,能夠在公眾大規模接種疫苗前,率先預測疫苗的功效。

 

徐仲鍈教授指出,實時預測疫苗功效可為決策者提供有用資訊,協助他們選擇最適合當地民眾的疫苗。

徐仲鍈教授指出,實時預測疫苗功效可為決策者提供有用資訊,協助他們選擇最適合當地民眾的疫苗。

 

王海天教授認為,適時掌握疫苗產品於群體中可達致的成效,有助疫苗製造商優化疫苗的病毒成分。

王海天教授認為,適時掌握疫苗產品於群體中可達致的成效,有助疫苗製造商優化疫苗的病毒成分。

 

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